O que você pode fazer é simplesmente brincar com permissões:
Crie um grupo para todos os usuários autorizados a usar o aplicativo, digamos sslusers
.
sudo groupadd sslusers
Encontre o programa do terminal (use qual), por exemplo, openssl. Altere sua propriedade de acordo:
sudo chown root:sslusers /usr/bin/openssl
Permitir a execução para o proprietário e o grupo. Negar para os outros:
sudo chmod 750 /usr/bin/openssl
agora vamos fazer um teste:
$ openssl
bash: /usr/bin/openssl: Permission denied
$ openssl -v
bash: /usr/bin/openssl: Permission denied
$ openssl version
bash: /usr/bin/openssl: Permission denied