Ok, vendo suas respostas ao meu comentário, estou listando um tipo de lista de verificação:
(Re) instale todos os pacotes php necessários do Odrej Sury PPA, conforme recomendado por ele e remover os repositórios ou pacotes que você adicionou, se houver algum .
sudo add-apt-repository ppa:ondrej/php
sudo add-apt-repository ppa:ondrej/php5-compat
sudo apt-get update
sudo apt-get dist-upgrade
Ele deve instalar as versões corretas do PHP no modo de compatibilidade. Em seguida, reinstale o módulo para o apache2, desative o módulo antigo e ative o novo:
sudo apt-get install libapache2-mod-php5.6
sudo a2dismod php5
sudo a2enmod php5.6
sudo service apache2 restart
E eu provavelmente atualizaria o Apache para usar o repo Ondrej também, como recomendado por ele no repositório PHP:
sudo add-apt-repository ppa:ondrej/apache2
sudo apt-get update
sudo apt-get dist-upgrade
Verifique as versões do php disponíveis e a padrão:
update-alternatives --query php
Se o php5.6 não estiver definido como padrão, configure-o (ou remova o php5.5):
sudo update-alternatives --set php /usr/bin/php5.6
sudo update-alternatives --set php-config /usr/bin/php-config5.6
sudo update-alternatives --set phpdbg /usr/bin/phpdbg5.6
sudo update-alternatives --set phpize /usr/bin/phpize5.6
Confira o changelog de recursos e alterações de configuração , você fez uma versão GRANDE pular de 2015 para 2018, particularmente o ldap, gallery e ziplib muda)
Verifique as configurações do php.ini recomendadas para o Dokuwiki
Se puder, refaça o upgrade / install seguindo as etapas da página do DokuWiki .
E, finalmente, verifique seu virtualhost , ele deve (provavelmente) ter a configuração AllowOverride como ALL para que o arquivo .htaccess incluído no DokuWiki funcione.
ps. Esqueci de pedir o error.log e o access.log, pode ser fácil identificar o erro, mas refazer os passos da maneira certa é uma boa ideia de qualquer maneira.