Uma solução simples, sem necessidade de outras aplicações ou software.
Apenas remova a conexão do seu armazenamento interno e mantenha seu externo conectado.
Agora basta instalar o Ubuntu 14.04 ou o que quer que seja no disco rígido externo.
Quando terminar, conecte seu armazenamento interno novamente.
Agora você tem uma unidade externa inicializável
Se você realmente quiser fazer isso com um software. você pode aproveitar o vasto:
sudo add-apt-repository ppa:gezakovacs/ppa
sudo apt-get update'
sudo apt-get install unetbootin