Você não pode usar várias versões de php a mod_php , o motivo é que você não pode carregar o mesmo módulo duas ou três vezes, o apache irá reclamar.
O melhor que você pode fazer é descarregar mod_php e usar mod_proxy_fcgi + PHP-FPM (de cada versão). O guia para configurar esta configuração é aqui .
Com a configuração do apache, você pode filtrar quais solicitações usam qual php-fpm backend daqueles que você configurou com versões diferentes.