Uma ferramenta como o TreeSize pode ser benéfica. A versão Pro pode fornecer relatórios bastante detalhados sobre o uso do arquivo para que você possa verificar as datas da última modificação das pastas em questão para ter uma ideia do último uso.
Se você quiser monitorar os compartilhamentos, precisará seguir a rota de auditoria e monitorar o Event Viewer. Aqui está um tutorial sobre como habilitar o Server 2008, mas ele deve ser semelhante a versões posteriores (é o ponto 7 desta página):
Boa sorte: -)