Eu aprendi sobre o wmctrl aqui: link que sugere o uso do seguinte comando para maximizar programaticamente as janelas:
wmctrl -i -r (windows ID) -b toggle,maximized_vert,maximized_horz
mas, por algum motivo, não está funcionando. Eu estou trabalhando no Ubuntu 14.04LTS. Alguém aí sabe por quê? Alguém sabe sobre uma alternativa?
EDIT: eu reiniciei e agora está funcionando! Mas infelizmente eu não sei se cometi algum erro antes ou reiniciar é realmente necessário.
Eu testei o seu comando tanto no Unity quanto no Gnome, e ele funciona bem em ambos os casos. Portanto, há uma chance de você cometer um erro no comando.
Se você quiser uma solução alternativa, você pode usar o comando xdotool :
xdotool windowsize <window_id> 100% 100%
Você precisaria, no entanto, instalar o xdotool:
sudo apt-get install xdotool