Se a segunda NIC estiver na mesma sub-rede que o controlador de domínio, ela deverá funcionar bem para se comunicar com essa sub-rede diretamente a partir dessa NIC (mesmo sem um conjunto de gateways). Em seguida, as coisas comuns a verificar seriam as configurações do Firewall do Windows para o NIC secundário ou, às vezes, os servidores dual homed podem ter complicações com os firewalls. É difícil saber se o problema do firewall é possível sem um layout de rede.
Além disso, você pode fazer o ping do DC via IP a partir do novo servidor com e sem a 2ª NIC? Tentar uma pesquisa de DNS pública também pode lhe dar algumas dicas.