Apenas no caso de alguém se deparar com isso no futuro, eu acabei por remediá-lo.
O servidor tinha duas placas de rede, uma em 192.168.0.1 e outra em 192.168.0.2, no entanto, a placa 0.2 não tinha um cabo de rede conectado a ela, no entanto, devido a algum tipo de ponte, ela estava voltando para o servidor corretamente.
Desativei a placa de rede 0.2 e alterei o servidor DNS para trabalhar com 0.1, em vez de 0.2, o que pareceu resolver o problema.