Você pode alterar o ambiente padrão do Octave criando o arquivo .octaverc no seu diretório home e colocando seus comandos lá.
-
crie um arquivo .octaverc em seu diretório pessoal
$ touch ~/.octaverc
-
coloque o comando desejado nesse arquivo.
cd ("~/Octave")
ou, você pode usar este comando de uma linha para fazer o mesmo que acima.
$ echo "cd (\"~/Octave\")" > ~/.octaverc