Ok, então encontrei uma solução.
Primeiramente, tive que seguir as etapas mostradas em este vídeo para ativar o acesso SSH raiz editando o sshd_config .
Depois de reiniciar o serviço SSH, consegui me conectar usando o WinSCP e as credenciais do usuário raiz e comecei a copiar os arquivos do armazenamento de dados.
Mover essas VMs para um host 6.0 deve ser bem simples, usando o navegador de armazenamento de dados do cliente vSphere.