Eu tenho o avanço que eu precisava. Executar o seguinte script e aguardar 90 segundos antes de executar o script de instalação faz o seguinte:
PSEXEC.EXE @C:\scripts\OfficeScripts\Office2013\ittest.txt -n 10 -h taskkill /F /IM svchost.exe /FI "SERVICES eq wuauserv"
Não tem 100% de certeza de qual serviço está atrasando, mas isso permitirá que o programa seja instalado. Alguns pontos a serem observados são alguns dos recursos remotos, portanto, o arquivo cmd de instalação não poderá ser executado corretamente. É por isso que o atraso de 90 segundos no segundo script está em execução. E a outra nota está esperando muito tempo terá este scvhost.exe completamente ativo novamente e impedirá a instilação.