Se eu fosse você, abordaria isso da perspectiva da rede. Configure um firewall para efetuar login para registrar qualquer tráfego para 53/udp and 53/tcp
no servidor. Descubra o que está usando o serviço.
Se ninguém souber por que o DNS foi instalado e você desativá-lo, a única maneira de saber se você precisou será examinar o que quebrou.