Não funcionará muito provavelmente. Dependendo do tipo de cluster de failover, a partição subjacente (ReFS / NTFS) e também o sistema de armazenamento.
De acordo com o artigo da Technet Instale o SQL Server com o SMB Fileshare como uma opção de armazenamento O SMB 3 é não suportado. Você pode dar uma olhada nos requisitos em Use Volumes Compartilhados do Cluster em um Cluster de Failover . No entanto, parece funcionar com o Microsoft SMB 3 (mesmo que seja especificado que não funciona).
Se você usa o VmWare, há uma extensa documentação desse lado no livro Virtualizando o SQL Server com o VMware: Fazendo o direito de TI .