Do jeito que você está descrevendo o seu problema, parece que você criou alguns sites no seu convidado, configurou uma pasta sincronizada e esperou que o vagrant realizasse uma sincronização bidirecional entre o host e o convidado. Não é assim que funciona. O que permite uma pasta sincronizada é montar uma pasta do seu host em seu convidado. O conteúdo do host mascara qualquer conteúdo existente no convidado. Aqui está o que eu quero dizer:
Sem uma pasta sincronizada
> dir C:\Users\daison\vagrant\src\www
a_file_on_the host
$ ls /var/www
a_file_on_the_guest
Com essas pastas sincronizadas.
> dir C:\Users\daison\vagrant\src\www
a_file_on_the host
$ ls /var/www
a_file_on_the host
Se você criou um novo arquivo a partir do convidado enquanto as pastas eram sincronizadas
> dir C:\Users\daison\vagrant\src\www
a_file_on_the host
file_created_while_synced
$ ls /var/www
a_file_on_the host
file_created_while_synced
Desativar a pasta sincronizada e agora você veria
> dir C:\Users\daison\vagrant\src\www
a_file_on_the host
file_created_while_synced
$ ls /var/www
a_file_on_the_guest
Então, se seus sites foram criados no guest, eles não estarão mais disponíveis enquanto você sincroniza / var / www . É por isso que o servidor da web "congela".