Este ajuste deve eliminar o seu problema. Use gpg como sugerido ou
set imap_pass='getpassword email_id'
onde você usa pwsafe ou senhas para buscar as senhas.
Edit: Se o mutt for criado com o suporte do IMAP (--enable-imap ), então mutt deve solicitar a senha se você não configurá-la no arquivo de configuração. Do manual:
imap_pass
Type: string Default: ""
Specifies the password for your IMAP account. If unset, Mutt will prompt you for your password when you invoke the fetch-mail function. Warning: you should only use this option when you are on a fairly secure machine, because the superuser can read your muttrc even if you are the only one who can read the file.