Para adicionar as respostas de jknox e JoorDaddee (e tratar da preocupação de papaiatis):
Desativar "rolagem natural" nas configurações não funcionou para mim e nem foi executado gsettings set org.gnome.desktop.peripherals.mouse natural-scroll false
, pois as duas já estavam desativadas.
O que funcionou para mim está executando gsettings set org.gnome.desktop.peripherals.touchpad natural-scroll false
. Isso corrigiu o mouse e o touchpad (desconectar o mouse e conectá-lo novamente fez com que funcionasse se não se aplicasse imediatamente).
Para ser claro, estou executando o Kali no VirtualBox, então não tenho certeza se isso se aplica ao contrário. Então, novamente, o OP não especificou em qual ambiente ele está executando o Kali.