Como eu não sei qual x11vnc você está usando (tenho três versões diferentes, existem outras) este é um tutorial para solucionar esse problema específico.
Primeiro, é entender as pranchetas envolvidas. Na maioria dos casos, há quatro deles envolvidos. (Mais é possível se você usar ferramentas de gerenciamento da área de transferência.) O X11 define três pranchetas: Primária, Secundária e Área de Transferência. O secundário raramente é usado (e quase certamente não é seu problema), então vamos ignorá-lo. Aplicativos que usam o clique do meio para colar (xterm, et al) normalmente usam a área de transferência primária. Aplicativos que fazem uma pasta de estilo do Windows (clique em editar, colar ou controlar V) às vezes usam apenas a área de transferência da área de transferência. Alguns aplicativos fazem as duas coisas (pastas do Google Chrome da primária com um clique do meio e da área de transferência com um controle V). Em seguida é a área de transferência VNC (apenas um) e há a área de transferência do Windows. (Se você estiver usando um visualizador vnc em execução no X11, as coisas ficam mais complicadas, mas isso fará sentido depois de pensar sobre isso.) A área de transferência VNC é especial, pois mantém várias atualizações das outras pranchetas para mantê-las encontro. Se você ignorar a área de transferência principal, isso é bastante simples, pois a área de transferência atualizada mais recentemente é copiada para todas as outras. O desafio é que o comportamento desejado da área de transferência primária não está bem definido. Eu vi os seguintes comportamentos de várias implementações vnc:
- Ignore o primário, use apenas a área de transferência.
- Ignore a área de transferência, use apenas o principal.
- Use o mais recente para unix para cópias do Windows, copie para ambos para o Windows para unix cópias.
- Tente ser inteligente: use o principal somente até que a área de transferência seja usada e use apenas a área de transferência.
- Tente ser mais inteligente: use o principal até que a área de transferência seja alterada, depois ignore o principal até que haja uma alteração das janelas e use o próximo alterado, ignorando novamente o principal após o uso da área de transferência.
- Tente ser ainda mais inteligente. (Eu nunca descobri o que eles estavam tentando fazer com este, mas geralmente fazia a coisa certa)
Em seguida, estão as ferramentas. Existem duas ferramentas que considero essenciais para depurar problemas da área de transferência: um editor de texto (o bloco de notas funciona bem para isso) e o xclip. Um visualizador da área de transferência do Windows é bom, mas não essencial.
Agora, o procedimento: A partir de cada aplicativo do grupo que você está solucionando, selecione e copie algum texto, verificando o status de todas as três pranchetas acessíveis. (A área de transferência do vnc é muito difícil de visualizar diretamente e não é diretamente útil, pois normalmente não armazena os dados, apenas os metadados.) Responda a estas perguntas: qual área de transferência cada aplicativo usa? que ordem eles são usados?
Espero que isso seja informação suficiente para você começar.