Eu tive um problema semelhante quando eu apt-get install unity em cima de uma instalação do Ubuntu 12.04 Server. O problema foi "resolvido" depois de eu apt-get install ubuntu-desktop . Então, acho que seu sistema está perdendo alguns pacotes.
A primeira coisa que você deve fazer é executar sudo apt-get -f install para garantir que não haja nenhum pacote quebrado e instalar o ubuntu-desktop ( sudo apt-get install ubuntu-desktop ). Se o problema persistir, instale o synaptic ( sudo apt-get install synaptic ) e prossiga para o próximo parágrafo.
Abra synaptic e selecione "Repositories" no menu "Settings", então mude para a aba "Other Software" e remova qualquer PPA que você tenha adicionado para instalar o Unity 7. De volta à janela principal do synaptic pressione o botão "Reload" (no barra de ferramentas).
Ainda no synaptic, pressione o botão "Custom Filters" (painel inferior esquerdo) e, em seguida, selecione o filtro "Missing Recommends" (painel superior esquerdo). Você deverá ver uma lista de pacotes recomendados que não estão instalados. Marque-os para instalação e pressione o botão "Aplicar" na barra de ferramentas.
Agora pressione o botão "Origem" e selecione o filtro "Local". Você poderá obter uma lista de pacotes que não pertencem a nenhum repositório. Revise a lista e (para cada pacote que você sabe que não instalou manualmente a partir de um arquivo .deb), selecione-o, abra o menu "Pacote", selecione "Forçar versão ..." e escolha a versão mais alta que está disponível (ou repositório de atualizações precisas ou de segurança precisa) (o nome do repositório estará entre parênteses). Quando terminar, pressione o botão "Aplicar".