Parece que você usou o fdisk ou uma das ferramentas ext2 para particionar a unidade. O tamanho máximo do disco para um disco particionado MBR é de fato 2.2TB. Você precisa ter a tabela de partição GUID para exceder esse limite. Aqui está uma página da Wikipedia .
A mensagem de erro que você recebeu parece sugerir o uso do Gparted para formatar esta unidade, então a implicação é que o Gparted entende as tabelas de partição GUID e pode escrevê-las.
Você ainda parecerá perder parte da capacidade, conforme os fabricantes de unidades dizem "3TB", quando o que eles realmente querem dizer é de 3.000.000.000 de bytes, o que corresponde a cerca de 2,7 TB reais. Como afirmado, você também parecerá 'perder' cerca de 5% das tabelas e alocações do sistema de arquivos para uma partição ext4. Na verdade, os 5% são baseados em 512 bytes / setor e eu não acho que isso se aplique nesse caso. O número final pode ser um pouco diferente. Você também pode querer assistir seus inodes se você tiver muitos arquivos pequenos nesta unidade - o número (de inodes) não pode ser alterado facilmente mais tarde, então faça sua pesquisa.