Para configurar o initramfs no Debian, você pode modificar /etc/initramfs/initramfs.conf ou adicionar arquivos de configuração e ganchos a /etc/initramfs/conf.d e /etc/initramfs/conf-hooks.d .
Para reconstruir o initramfs, execute update-initramfs como root com as opções apropriadas ( update-initramfs -u para atualizar o initramfs do kernel mais recente).
Tudo isso está no initramfs-tools e há manpages documentando os vários comandos e arquivos de configuração.