A questão é subjetiva.
O EXT4 é considerado estável e suporta o registro no diário (assim como o EXT3, mas não o EXT2), o que ajuda na corrupção.
O BTRFS ainda é experimental, mas oferece muito mais recursos.
Reiser4 , TUX3 , XFS , várias implementações do ZFS , etc. há muitas opções .
Pessoalmente, uso o EXT4 em todas as minhas unidades e não tive problemas com o FS.
Não tenho conhecimento de nenhum benchmark de estabilidade (embora possa haver alguns 'white papers'), mas o Phoronix tem benchmarks de desempenho
Por último, esta questão pode ser uma cópia de Sistema de arquivos estável em rocha para arquivos grandes (backups) para linux