Este é mais um golpe de alto nível em uma resposta.
O projeto android foi fundido em grande parte no kernel do Linux há algum tempo. Eu suspeito que o primeiro passo é rever o que tudo foi incluído nessas fusões. Você teria que recompilar o kernel para acomodar essas mudanças. Eu acho que eles incluíram em grande parte as coisas para tornar um sistema estável estável, os telefones são ligados e desligados o tempo todo os servidores não são.
O próximo passo deve verificar se os drivers do Linux para esse chipset acomodam a funcionalidade que você precisa ativar. Se assim for, há uma grande chance de você ativar a chamada. Talvez seja necessário ler o driver para ativar a chamada e assim por diante.
Eu tenho uma suspeita de que pode ser realmente trivial para acertar se você pode enviar comandos AT para o chip, você deve ser capaz de fazê-lo discar ou responder a chamadas. Então o truque é conectar o microfone e o alto-falante às conexões que ele abre. Dado que é linux, pode até ser tão trivial quanto pipilar seu microfone para o transmissor de chips de telefone, mas estou apenas adivinhando isso.