Não é possível instalar xdotool
porque você não é root não significa que não pode executar o programa, pois você não precisa de privilégios especiais.
Basta fazer o download e compilar da origem .
Se você não tiver acesso a um compilador, poderá fazer o download do pacote diretamente para o sistema e extrair o arquivo do pacote (para .deb
, use ar
, a extração de .rpm
pode ser feita com rpm2cpio
)