A ../
é a notação para "o diretório pai", portanto, no caso apresentado:
/usr/local/bin/../../etc/yarbu/conf/default
O sistema resolverá isso como:
/usr/etc/yarbu/conf/default
É como se você estivesse no diretório /usr/local/bin
e digitasse cd ..
duas vezes, agora você estaria no diretório /usr
.
Você mesmo pode verificar isso:
$ cd /usr/local/bin
$ pwd
/usr/local/bin
$ cd /usr/local/bin/../../../
$ pwd
/