Resposta parcial:
O superbloco do seu sistema de arquivos ficou ilegível. O superbloco é o bloco mais importante, porque contém as informações de como o sistema de arquivos está configurado.
Todos os sistemas de arquivos mais novos usam o chamado journal : blocos novos ou alterados são escritos para alguma área contígua primeiro e, eventualmente, substituem os blocos na área "normal". Isso facilita a recuperação: o programa de recuperação examina o diário, verifica quais transações foram concluídas antes da falha e, em seguida, pode restaurar o sistema de arquivos para um estado consistente da última transação bem-sucedida. Isso também significa que as alterações mais recentes são perdidas após uma recuperação, mas geralmente são apenas pequenas alterações.
É difícil dizer o que aconteceu no seu caso porque você não deu informações sobre como foi o processo de recuperação. O sistema de arquivos contém cópias do superbloco, então você deve ter conseguido usar uma cópia em vez da corrompida, acessar o diário a partir da cópia e restaurar o sistema de arquivos quase ao mesmo estado que você tinha antes o problema.
Como você disse que perdeu alguns arquivos mais novos, meu palpite é que o programa de recuperação não conseguiu restaurar o superbloco e, portanto, fez algumas suposições, e por causa disso ou por causa de alguns outro motivo não foi possível encontrar o diário, então você perdeu todas as alterações no diário, em vez de apenas a última transação incompleta.
Em geral, sistemas de arquivos mais novos como ext4 são melhores na recuperação (possivelmente com alguma entrada manual durante a recuperação) do que sistemas de arquivos mais antigos como ext2 ou FAT. Se estes ficarem corrompidos, você perde o que estava corrompido. Em sistemas de arquivos registrados, é quase sempre possível voltar a um estado consistente que não esteja muito longe do estado quando o problema ocorreu. Então, a resposta para a pergunta no assunto é "de maneira alguma, muito pelo contrário".
Você pode usar as opções de montagem para influenciar com que frequência e de que maneira o diário é gravado e as transações são confirmadas, para que você possa negociar maiores chances de recuperação para o desempenho.