Com wmctrl :
wmctrl -a Stardict
Com xdotool :
xdotool windowactivate $(xdotool search --class Stardict)
Eu usei Stardict para a classe da janela, verifique se está correto com xprop (execute xprop em um terminal, clique em uma janela Stardict não-iconificada e verifique a linha WM_CLASS ).