Parece que você perdeu as permissões. Sua distribuição configurou um grupo audio
? O seu usuário é um membro desse grupo?
Qual versão do JACK você instalou? O JACK2 é o preferido, e acredito que o Debian fornece configurações decentes. Para instalar o JACK2, execute este comando ...
sudo apt-get install jackd2
Se você já tem o jack2 instalado, reconfigure assim ...
sudo dpkg-reconfigure -p high jackd2
Se você ainda estiver com problemas para comentar, eu irei acompanhar.