Existe um programa de linha de comando chamado rsync que é capaz de sincronizar dados com eficiência entre computadores diferentes em uma rede (ou entre pastas na mesma máquina). Se você não tem medo da linha de comando, você pode usar isso imediatamente.
Existem também vários invólucros em torno do rsync, como Conduit, GRSync, gtkrsync, unison, luckybackup, mrb e possivelmente outros. Todos eles estão disponíveis nos repositórios do Ubuntu para que você possa instalá-los apenas através do Centro de Software e ver qual deles você mais gosta.
Essas aplicações não são específicas para o Ubuntu 11.10 e estão disponíveis há algum tempo.