Isso provavelmente tem a ver com o fato de que para uma montagem apenas pronta (que provavelmente é o caso de uma chave usb do clonezilla), um workdir não é necessário e é deixado em branco na configuração da montagem do OverlayFS. Assim, o aviso está dizendo que está faltando, mas neste caso isso não é nada para se preocupar.
Você pode seguir em frente e clonar sua partição!