Uma das muitas maneiras de alterar as configurações em um ambiente de área de trabalho é usar as ferramentas fornecidas com esse ambiente. Nesse caso, o XFCE é um ambiente de área de trabalho e oferece essas ferramentas, algumas com interface gráfica.
E a maneira mais simples de alterar a resolução é usar "Display", que pode ser encontrado em Application Menu > Settings > Display
ou pode ser invocado no emulador de terminal usando o comando xfce4-display-settings
.
Claro que se você não gosta de uma solução gráfica, você sempre pode modificar manualmente o respectivo arquivo (neste caso .config/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/displays.xml
)