Você deve estar bem. Cada front end terá seu próprio conjunto de valores de configuração, mas no que diz respeito ao seu sistema, o backend (no seu caso o sistema de pacotes Debian) terá o banco de dados de pacotes para todo o sistema de coisas que foram instaladas etc. / p>
As informações sobre o seu sistema não estariam em seu diretório pessoal de qualquer maneira:)