Se a configuração de sombra estiver no tema, você terá que editá-la dentro do tema.
Como editar um tema:
cd /usr/share/themes/Ambiance/metacity-1
sudo nano metacity-theme-1.xml
Encontre a linha (use CTRL + W para pesquisar) que diz:
<shadow radius=”45.0″ opacity=”0.75″ color=”#abde4f” x_offset=”1″ y_offset=”4″/
Altere o raio para um valor com o qual você possa lidar ... Eu escolhi 10.