LTS não significa que não haverá atualizações. LTS significa que os pacotes receberão pequenas atualizações para corrigir bugs e problemas de segurança quando o suporte 'padrão' para a versão for interrompido. Dá-lhe a opção / possibilidade de utilizar o seu servidor de uma forma segura, sem ir para a próxima versão que eles suportam. A próxima versão geralmente requer uma instalação completa.
Se você não quiser ter esse tipo de atualização, não faça atualizações automáticas. Você pode decidir quais atualizações você faz manualmente. Eu não consideraria essa boa prática, pois isso enfraquece seu servidor.