Como roaima menciona , você pode usar equivs para isso. Instale o pacote equivs e execute
equivs-control yourpackage.control
(substituindo yourpackage por algo apropriado para sua situação).
Isso criará um modelo yourpackage.control file; edite-o para que sua linha Depends: liste as dependências desejadas; você também deve preencher a linha Version: . Então corra
equivs-build yourpackage.control
e instale o pacote .deb resultante (que aplicará as dependências).