Você pode usar xdotool para produzir eventos de teclado. Veja o manual e os exemplos de como segmentar uma janela específica.
xdotool key ctrl+alt+Left
Se isso for para acionar uma funcionalidade do Gnome ou do gerenciador de janelas, pode haver uma ferramenta de linha de comando separada para isso. Por exemplo wmctrl obtém e altera os parâmetros da janela, como títulos, posição, etc.
Da mesma forma, se isso disparar uma funcionalidade de um aplicativo específico, pode haver uma maneira de fazer isso diretamente. Claro que isso depende inteiramente da aplicação.