O pacote hardinfo ( link ) é um benchmarker bastante decente do sistema, com uma boa GUI. A maneira mais simples de comparar os dois seria comparar um com os resultados e depois compará-lo ao seu benchmarking do outro.
EDITARDependendo da sua distro, você pode já ter o hardinfo instalado, por exemplo, no Lubuntu, ele é chamado "System Profiler and Benchmark".