O que a outra resposta diz.
Em um pouco mais de detalhes: eu sugiro, em primeiro lugar, que você faça uma limpeza do APT e, em segundo lugar, faça uma atualização completa do sistema a partir do shell.
1: limpeza
sudo apt-get clean sudo apt-get autoclean sudo apt-get purga sudo apt-get autoremove -y
2: atualização completa
sudo apt-get update sudo apt-get dist-upgrade -y
Em seguida, reinicie. Eu suspeito que você vai encontrar seus erros na ferramenta de atualização GUI terá ido. Eu tive problemas semelhantes com o atualizador de GUI do Mint eu & agora eu prefiro usar o shell.