Tente isto:
cd /usr/ports/mysql56-server
make install > /home/mysql.install.log 2>&1
Provavelmente, algumas saídas são impressas em stdout , algumas em stderr . Assim, você pode salvar todas as saídas por meio do redirecionamento stderr para stdout e, em seguida, gravar stdout em um arquivo.
Você também pode usar o comando tee :
make install 2>&1 | tee /home/mysql.install.log
n.b. O redirecionamento stderr ainda é necessário para pipes.
@Nishan
Se você usa csh , tente isto:
make install >& /home/mysql.install.log