Você tem várias opções disponíveis. Escolha um que você está mais confortável com. Um potencial seria configurar um compartilhamento SMB / CIFS no host Unix.
Em um script de cada estação de trabalho do Windows, monte o compartilhamento SMB / CIFS com o comando net .
net use \computername\sharename /persistent:no
Após a conclusão do copy ou move do arquivo para o compartilhamento SMB / CIFS, você poderá remover o compartilhamento da estação de trabalho do Windows.
net use \computername\sharename /delete
Você pode obter opções completas do comando net executando net help use . Aqui está um bom guia não oficial para configurar o Samba.