Você precisa tornar o public_html e os arquivos legíveis pelo servidor web.
Uma maneira é executar chmod o+x /home/user
(permitir que todos alternem para o diretório inicial)
e chmod -R o+rX /home/user/public_html
(torne public_html e arquivos lá legíveis por todos).
Se você precisar de melhores controles de acesso, use as ACLs.