Existe um programa chamado unclutter , que oculta o ponteiro do mouse quando não está em uso.
Para instalá-lo no fedora (se ainda não tiver):
dnf install unclutter
E comece com a opção -idle para definir o número de segundos antes de o ponteiro ficar oculto, por exemplo:
unclutter -idle 2 &
Você pode adicionar a linha acima a .xinitrc ou arquivo de inicialização semelhante.