A compactação é negociada junto com a criptografia e a autenticação de fluxo e aplica-se a todos os dados transmitidos pela conexão SSH, incluindo os comandos do protocolo. A compactação, quando usada, é aplicada seguida pela autenticação de fluxo e, em seguida, pela criptografia. Os dados resultantes são enviados pela Internet. Todos os túneis / encaminhamentos de porta / sessões de terminal são enviados pelo mesmo fluxo de compactação. O protocolo de transporte para SSH é especificado em RFC4253 .