Pressione Alt + F2 e digite gconf-editor . Navegue no menu da árvore para a área de trabalho > gnome > sessão > componentes obrigatórios. Agora, substitua a chave windowmanager pelo gerenciador de janelas de sua escolha. Apenas substitua gnome-wm (ou metacity) por mutter.
Outra solução possível:
Você pode adicionar mutter --replace ao Sistema > Preferências > Aplicativos de inicialização que abre o programa gnome-session-properties :