Por alguma razão, o qBittorent tornou-se o programa padrão para abrir arquivos pdf. Apenas reatribuir a associação de arquivos com evince.
Para fazer isso:
- Clique no arquivo e selecione Propriedades
- Escolha a guia "abrir com" para aplicação padrão
- Selecione o visualizador de documentos e clique em "definir como padrão"