Eu fiz a mesma pergunta há algum tempo e escrevi um artigo sobre como você pode fazer isso.
Primeiro de tudo, você pode correr
make -DBATCH install clean
para aceitar a configuração padrão para todos os pacotes (também para dependências). Se você quiser configurar todas as dependências, você pode executar
make config-recursive
Você precisa executar
make config-recursive
quantas vezes forem necessárias para configurar todas as dependências. Isso acontece porque, enquanto você está configurando dependências, essas dependências podem ter mais dependências que precisam ser instaladas e configuradas.
Então você pode correr
make install clean
Afinal, caso você queira reconfigurar ou excluir a configuração, você precisa executar:
make rmconfig-recursive
Você também pode dar uma olhada no meu artigo: link