Se você já desativou a configuração no BIOS e a desativação dos módulos não ajuda, como descrito abaixo, então você provavelmente tem um bug no BIOS.
Desativar o interlocutor interno:
sudo modprobe -r pcspkr snd_pcsp
Para uma solução permanente, edite /etc/modprobe.d/blacklist.conf
sudo nano /etc/modprobe.d/blacklist.conf
e adicione / altere
# low-quality, just noise when being used for sound playback, causes
# hangs at desktop session start (Ubuntu: #246969)
blacklist snd_pcsp
# ugly and loud noise, getting on everyone's nerves; this should be done by a
# nice pulseaudio bing (Ubuntu: #77010)
blacklist pcspkr