$ paste prices fruits | sort -k2 | cut -f1
1.01
2.18
4.11
4.52
1.73
1.69
1.09
paste combina os dois arquivos, linha por linha. sort -k2 classifica-os na segunda coluna (o nome da fruta). cut -f1 retorna apenas a primeira coluna (os preços).
Pelo exposto, presumi que os números de linha mostrados na exibição dos arquivos fruits e prices eram um artefato do software de exibição e não faziam parte dos arquivos reais.