Sim, é seguro. Essa é uma das coisas que o LVM fez especificamente: permitir que o armazenamento lógico se estenda além de qualquer volume físico único. Se os volumes físicos são partições no mesmo disco, ou partições em discos diferentes, ou mesmo discos inteiros com a tabela de partição omitida, não importa para o LVM.
Nomear LVs de acordo com os PVs em que residem originalmente, como você fez com LV /dev/fedora/sda6 , é meio bobo. Por exemplo, se você quisesse mover essa instalação do Linux para um disco diferente, você poderia pegar um novo disco vazio e criar duas partições: a partição / boot e outra partição para um PV do LVM. Então você poderia usar pvmove para mover a parte principal de sua instalação do Linux para o novo disco - enquanto o Linux está rodando. Então é só uma questão de copiar o conteúdo da partição /boot para o novo disco e instalar o bootloader nele - e o nome LV sda6 seria completamente sem sentido.
Você ainda tem uma partição /boot separada, portanto, não há risco de os arquivos de inicialização terminarem fora do disco de inicialização. Se seu diretório /boot fosse apenas um diretório regular no sistema de arquivos raiz, e você estendesse o LV raiz para outro disco, os arquivos de inicialização - ou apenas parte deles - poderiam acabar no outro disco, e isso seria uma situação que pode ser muito complicada para o gerenciador de inicialização.
Quando você tem /boot como uma partição tradicional, ele garante que os arquivos de inicialização (= componentes bootloader, kernel e initramfs) permaneçam no disco escolhido como inicializável no firmware do sistema (= BIOS ou UEFI), que torna as coisas muito mais simples: garante que o gerenciador de inicialização tenha que lidar com apenas um tipo de controlador de disco, apenas um esquema de particionamento, e apenas um disco, do qual o firmware definitivamente pode ler.
