O Sudo apenas executa o primeiro comando, no seu caso "echo" abc-abc / abc / abc "".
Portanto, o resto do comando (escrito em /etc/portage/make.conf) será executado no modo de usuário.
Você só precisa modificar as permissões no arquivo usando chmod.
Estou tentando inserir um texto em um arquivo da seguinte maneira
sudo echo "abc-abc/abc/abc" >> /etc/portage/make.conf
mas isso me dá o erro Permissão negada
embora eu esteja usando o comando sudo
Nessa linha de comando, o shell abre o /etc/portage/make.conf no modo de anexação, é o stdout de um novo processo e executa sudo nesse novo processo. Não é sudo nem echo que abre o arquivo, é o seu shell que está sendo executado com suas credenciais.
Você precisaria que o arquivo fosse aberto pelo comando iniciado como root. Então pode ser:
sudo sh -c 'echo "abc-abc/abc/abc" >> /etc/portage/make.conf'
Ou:
echo "abc-abc/abc/abc" | sudo tee -a /etc/portage/make.conf > /dev/null