No que diz respeito a cursos online completos (palestras em vídeo, questionários, discussões em grupo, etc.), todos os grandes MOOCs têm algum conteúdo Linux, por exemplo:
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Cursos LinuxFoundationX (Cursos Linux no EdX)
Existem também alguns sites de treinamento focados em tecnologia e específicos do Linux:
Depois, há os sites de tutorial em vídeo, por exemplo:
Com relação a quais habilidades aprender, você pode querer examinar um programa de certificação do Linux. Eu fiz um pouco de pesquisa sobre isso e, para uma certificação genérica (isto é, não específica do fornecedor), parece que há basicamente três organizações a serem consideradas:
E para a administração de sistemas Linux de nível básico, eles fornecem as seguintes certificações:
Observe que a CompTIA e o LPI estão trabalhando juntos e que suas certificações se sobrepõem um pouco, por exemplo, veja o seguinte post:
O LPI também oferece uma certificação muito introdutória para principiantes absolutos:
Além disso, a CompTIA e a Linux Foundation oferecem treinamento e preparação para exames, alguns dos quais on-line:
Você também pode achar a seguinte postagem (mais antiga) útil: